Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CebpbP28033 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CebpbP28033 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CebpbP28033 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms