Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RdxP26043 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RdxP26043 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RdxP26043 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RdxP26043 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RdxP26043 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RdxP26043 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RdxP26043 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RdxP26043 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RdxP26043 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RdxP26043 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RdxP26043 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RdxP26043 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RdxP26043 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RdxP26043 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RdxP26043 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RdxP26043 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms