Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Aldh1a1P24549 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms