Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd247P24161 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd247P24161 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms