Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd12P23812 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd12P23812 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms