Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PparaP23204 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PparaP23204 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PparaP23204 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PparaP23204 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PparaP23204 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PparaP23204 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PparaP23204 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PparaP23204 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PparaP23204 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PparaP23204 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms