Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpcP21841 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpcP21841 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpcP21841 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SftpcP21841 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms