Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkcaP20444 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms