Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms