Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lama1P19137 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lama1P19137 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms