Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms