Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsdP18242 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms