Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd48P18181 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd48P18181 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd48P18181 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd48P18181 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd48P18181 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms