Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb1P13372 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms