Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn1P12960 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms