Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms