Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Surf2P09926 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Surf2P09926 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms