Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd3P09027 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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