Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb7P09024 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb7P09024 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms