Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Egr1P08046 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr1P08046 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms