Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SparcP07214 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SparcP07214 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SparcP07214 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SparcP07214 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms