Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa4P06798 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms