Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06336 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06336 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06336 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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P06336 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06336 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06336 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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