Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PdgfrbP05622 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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PdgfrbP05622 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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PdgfrbP05622 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PdgfrbP05622 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PdgfrbP05622 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PdgfrbP05622 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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