Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf3P05524 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf3P05524 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms