Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb1P04202 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb1P04202 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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