Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtnd1P03888 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms