Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-AaP01910 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms