Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01822 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01822 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01822 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01822 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01822 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms