Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01656 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01656 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01656 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01656 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01656 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01656 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms