Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01635 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01635 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01635 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01635 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01635 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01635 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01635 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms