Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sp1O89090 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sp1O89090 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms