Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gnpda1O88958 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gnpda1O88958 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms