Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BlmO88700 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BlmO88700 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BlmO88700 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BlmO88700 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BlmO88700 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BlmO88700 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
BlmO88700 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BlmO88700 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BlmO88700 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BlmO88700 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms