Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cops4O88544 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops4O88544 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms