Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnal1O88327 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnal1O88327 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms