Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col5a1O88207 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a1O88207 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms