Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtogO55225 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtogO55225 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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OtogO55225 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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OtogO55225 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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OtogO55225 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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OtogO55225 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtogO55225 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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OtogO55225 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtogO55225 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtogO55225 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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OtogO55225 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms