Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ldb2O55203 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ldb2O55203 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ldb2O55203 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb2O55203 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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