Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tlx3O55144 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tlx3O55144 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms