Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp2a2O55143 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms