Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg2O55111 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms