Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BckdkO55028 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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BckdkO55028 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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BckdkO55028 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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BckdkO55028 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BckdkO55028 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BckdkO55028 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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