Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacna1bO55017 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms