Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LatO54957 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LatO54957 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LatO54957 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LatO54957 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LatO54957 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LatO54957 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LatO54957 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms