Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb3O54890 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms