Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TsksO54887 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TsksO54887 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TsksO54887 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TsksO54887 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsksO54887 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsksO54887 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TsksO54887 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TsksO54887 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TsksO54887 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TsksO54887 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsksO54887 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsksO54887 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms