Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk2O54781 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk2O54781 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms