Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Klf9O35739 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Klf9O35739 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms