Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Ppfibp2O35711 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfibp2O35711 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms